经过一天的折腾，终于问题解决了，只是还是不明所以，折腾的过程记录一下：

首先删除了C:\Users\"user name"\AppData\Local\Microsoft\Microsoft SQL Server Local DB\Instances\ 路径下的WINCCFLEX2014 文件夹，然后依次做了以下几步

1、在控制面板\ 程序和功能里，卸载了 Microsoft SQL Server 2014 Express LocalDB

2、在 wincc7.4 的安装包内 WinCC_v7.4\InstData\SQL\SQL2014EXPSP1\setup\SQLEXPR_x86_ENU 找到SQL2014EXPSP1的安装文件，安装好

3、在WinCC flexible 2008 SP4安装包内 WinCC flexible 2008 SP4\InstData\SQLExpress，找到SQLExpress.exe 安装

4、在WinCC_flexible_SMART_V3SP2安装包内WinCC_flexible_SMART_V3 SP2\InstData\SQLLocalDB\X64  找到SqlLocalDB.msi 安装

5、在控制面板\ 程序和功能里，选中WinCC flexible SMART V3 SP2 右键 更改，然后选择修复

6、重启电脑，在域内登录windows账户，查看 C:\Users\"user name"\AppData\Local\Microsoft\Microsoft SQL Server Local DB\Instances\ 路径下仍然没有WINCCFLEX2014文件夹，心里一凉，觉得可能白折腾了

7、打开 WinCC_flexible_SMART_V3 SP2新建一个项目，发现正常了，第6步没找到的WINCCFLEX2014文件夹自动生成了。打开以前的项目测试，均能正常打开。

其中第3步可能没有起作用，因为安装后我发现装的是 SQLExpress 2005版 与WinCC_flexible_SMART_V3 SP2要求的2014版不同