楼上各位说的我都已经试过，没有效果。
1、用项目复制器来复制工程和在WINCC V5.0下将WINCC安装目录BIN\下的*RT.DB这个文件拷贝到你的工程下,更改成你的工程名称就可以将实现运行数据库清零了!这两种方法对WINCC6.0以下版本有效，对V6.0以上好象不行。
2、打开变量记录 ，在归档组态中有两个归档模式，分别右键单击它们，在弹出的对话框中点击重置，可以将归档的数据库清零。这种方法只能清除WINCC项目下的ArchiveManager文件里的记录，对RT.DB数据库好象没有用。

我所使用的WINCC V6.0的项目下那个rt.db的数据库文件有4G多，现在一直没有找到减少它容量的方法，看各位还有其他好的办法没有。