感谢各位的建议和发言。
因为是轻工业系统，死机虽影响生产，但还不至于出大事故，客户最近生产比较紧就凑或着在用。不能给我们多少时间慢慢调。前两天趁短停车的机会把主站的模块全换了一遍，包括背板总线。但效果还是不行。
MMC卡的容量是够的，原来的128k运行中我监视最多不超过50%的空间占用，内存也是。我换了个2M的大卡之后就基本上不考虑这个问题了。
主站上有个模拟量输入。用的是两线制电流，看了一下手册，和背板不隔离，就让用户把上面的输入全都拆了，可还是不行。
个人感觉，应该还是EMC的问题可能性最大。这两天让客户找供电局的人帮忙测他们两个接地的接地电阻，等结果出来再看。和西门子沟通了一下，下一步打算再主站出口装个中继试一下（系统里原来有一个了）。再不行我打算把主站改造成只挂CPU的主站加一个分站。就等接地电阻测量结果出来看有没有必要做了。