最后终于发现。。。。

计算机上装有不兼容的软件，修改计算机默认配置，关闭了共享权限。在WINCC在运行时，项目文件会变成共享文件夹，虽然项目文件在本机上，但是WINCC必须要以访问共享文件夹的方式运行才能读取到WINCC文件，当出现假死现象时，发现此时原本共享的文件夹此时已经不是共享的了，想手动在选择共享时发现，右键选项里面已经没有了文件夹共享这一选项，而且此时就算新建一个文件夹，也依然没有右键文件夹共享这一选项，再做试验，开机不运行WINCC以及相关工控软件，15分钟左右，新建一个文件夹，依然不能右键实现文件夹共享，由此断定，此原因不是工控软件造成的。
发现共享权限总是在开机一段时间以后关闭，刚开机的时候可以新建共享文件夹，15分钟后就不能了，最终确定为WINDOWS网络组件服务被关闭了，WINDOWS 2003 COMPUTER BROWSER服务被关闭了，此时手动开启此服务后，一段时间后又一次自动关闭。
网上查询发现，计算机如果网络内装有网络监控类软件会引起这方面的故障，微软在针对此类故障上出了两个补丁，KB958644，KB921883，补丁打好后，开机不再出现错误，WINCC运行正常，自5月20号至今，再没有出现计算机假死现象。