WinCC和大部分国外的上位机软件（InTouch和iFix）类似，运行环境相对比较复杂，例如后台数据库和相关的服务进程，很难象Visual Studio一样生成.exe文件，或是打包安装，所以WinCC的加密没有特别好的办法。

目前的权宜之计是使用选件SIMATIC Logon，它的方法是要把WinCC集成在STEP7中，利用SIMATIC Logon对于STEP7项目的加密来实现对WinCC项目的保护，即使该项目被拷贝到其它计算机上，如果没有在原计算机上SIMATIC Logon中配置的用户名和密码，是无法打开STEP7及集成的WinCC项目的。
但SIMATIC Logon仅限于项目级别的保护，项目文件夹下面的.pdl画面文件还是可以被拷贝挪作它用，但变量、变量记录和报警记录是无法导出的；而脚本的保护还是依靠全局脚本中的加密。
SIMATIC Logon在WinCC V7.0之前是需要单独订货的，而从WinCC V7.0 SP1之后其软件和授权包含在WinCC的安装包里。

SIMATIC Logon主要是对STEP7项目进行保护，也就是说，WinCC通过集成到STEP7中，作为STEP7项目的组件也得到了保护，如果不安装STEP7进行WinCC集成的话，SIMATIC Logon对于WinCC就没有保护作用了。