S7-1200的程序结构与S7-300/400基本上相同，为了兼容IEC 61131-3标准，有一些区别。例如除了主程序OB1以外，还可以生成其他的程序循环组织块，默认的编号为OB200。在OB1和OB200中分别编写简单的程序，例如用输入点控制输出点，下载后运行，可以看到两个OB中的程序都能正常运行。
除了默认的初始化组织块OB100以外，另外生成一个编号为OB201的初始化组织块。
分别在OB100和OB201中用指令INC将没有保持功能的一个字节加1。将它们下载到CPU，切换到RUN模式后，可以看到INC指令使MB14和MB16的值加1，说明启动时分别只调用了一次OB100和OB200。